Nai sangai được cho là gần như tuyệt chủng bởi 1950. Tuy nhiên, vào năm 1953 sáu con sangai đã được tìm thấy ở môi trường sống tự nhiên của nó. Kể từ đó, Chính phủ và Nhà nước đã có những biện pháp nghiêm túc và tích cực đối với việc bảo vệ các loài quý hiếm và đang bị đe dọa này. Một cuộc điều tra được tiến hành vào năm 2000 tại công viên cho thấy có 162 chỉ hươu (54 nai đực, 76 nai cái và 32 nai con).

Các con nai sangai phải đối mặt với một nguy hiểm theo hai hướng để cuộc sống của mình. Thứ nhất, môi trường sống của nó đang dần thoái hóa vì lý do ngập lụt liên tục và lũ lụt do nước cao gây ra như là kết quả của hồ chứa nhân tạo của các dự án thủy điện Loktak. Thứ hai, những kẻ săn trộm được ra khỏi đó để bẫy và giết con nai ở cơ hội dù chỉ là nhỏ nhất.

Trong năm 1983, các dự án thủy điện công suất 103 megawatt của Loktak được thực hiện với mục tiêu đảm bảo sự phát triển nhanh chóng về nhà nước. Mực nước cao nhất 168.5 mét (553 ft) trên mực nước biển trung bình (MSL) được lưu giữ trong hồ Loktak để nuôi các hồ chứa cho các dự án hydel. Mực nước cao này đã tàn phá tại Vườn quốc gia Keibul Lamjao. Mực nước cao, duy trì liên tục qua các năm, đã bị xáo trộn chu kỳ đời sống tự nhiên của sự tăng trưởng thực vật, các phumdi, khi mà Nai sangai phát triển mạnh. Con nai ăn một số loại thực vật mọc trên các phumdi. Thảm thực vật cũng cung cấp nơi trú ẩn cho những con nai và động vật hoang dã khác trong công viên.

Vòng đời của các phumdi liên quan đến giá thể nổi trên mặt nước trong mùa nước cao như trong các đợt gió mùa. Trong mùa khô, khi mực nước giảm, sinh khối tiếp xúc với đáy hồ và bảo đảm chất dinh dưỡng cần thiết từ đó. Khi những cơn mưa trở lại và chúng trở nên nổi, sinh khối có đủ 'thực phẩm'-các chất dinh dưỡng được trữ trong rễ và cuộc sống của chúng vẫn tiếp tục. Với mực nước cao liên tục trong hồ trong suốt năm phần lớn quá trình này 'ăn' trên các chất dinh dưỡng trong lòng hồ đã ngưng. Các kết quả sinh khối đang giảm.

Khoảng tháng tuần trước vào năm 1999, nó đã được báo cáo rằng một phần lớn của sinh khối ở phần phía bắc của công viên quốc gia đã bị phá vỡ thành các mảnh và đã trôi dạt tự do từ các khu vực công viên. Đây là một dấu hiệu xấu cho môi trường sống Nai sangai. Nó nêu ra rất rõ ràng rằng sự khởi đầu của sự kết thúc của môi trường sống Nai sangai đã bắt đầu. Có những báo cáo của người dân địa phương cắt lên các phumdi thành miếng khá lớn và sau đó kéo ra những chiếc xuồng độc mộc với cho 'bán' cho các chủ nuôi cá. Đây là một mối nguy hiểm tiềm tàng đối với môi trường sống Nai sangai.